Il y a 2 aspects distincts.
Le premier : pour que votre sœur puisse continuer à occuper le logement il vous faudra l'autorisation du juge pour signer un bail de location, suite à une requête que vous lui aurez adressée en mentionnant le montant du loyer (bas, peut-être, mais loyer quand même)
Le deuxième : vos neveux n'ont rien à voir dans la gestion des biens de leur grand-mère, sauf à son décès...Si un héritier (votre sœur) a bénéficié d'une occupation gratuite du logement, les autres héritiers (vous et vos neveux) peuvent alors demander à intégrer dans la succession le montant des loyers théoriques correspondant à l'occupation gratuite...d'où la quasi nécessité de faire valider le bail de location par le juge.
Vous pouvez essayer d'argumenter le faible loyer : vétusté, nombreux travaux de réhabilitation à charge du locataire, manque d'isolation thermique, occupation par un enfant, ce que souhaitait votre mère...Une fois l'autorisation acquise par le juge, il sera beaucoup plus compliqué pour vos neveux de contester le faible loyer.
Le 'hic" : que le juge vous demande une estimation de loyer par des agences immobilières !